Zero es un Reploid construido por el Doctor Willy en su afán de detener a Rockman y controlar a Forte, el Doctor Willy tomo su tiempo en su creación llamándolo a Zero su obra maestra.
En el transcurso de su creación Wily hablaba con Zero en un estado semi-conciente, pero Zero nunca fue utilizado por Willy en sus planes dado que Zero era rebelde y agresivo con su creador dando le a Wily la única opción de sellarlo dentro de un capsula.
Varios siglos han pasado desde que Zero fue encapsulado por su creador asta que la unidad Gamma de sigma lo encontró liberándolo de su capsula en ese momento Sigma que era el líder de los Maverick Hunters decide enfrentarse a el siendo el vencedor de esa batalla (en este momento Zero infecto a Sigma con el Virus Zero).
Zero fue llevado por Sigma ante el Doctor Caín quien le instalo un chip de auto-control y puesto en vigilancia por otro Reploid, en el momento que Zero al ya no demostrar comportamiento rebelde se izo amigo del Reploid del cual seria su compañero de batallas X
LAS GUERRAS MAVERICK Zero la ser uno de los pocos Maverick Hunters sobrevivientes y leales ala Humanidad tras la rebelión de Sigma se vuelve líder temporal de ellos movilizándolos ante los ataques de Sigma. Tras conocer que X avía ido a detener solo el ataque Maverick en la autopista principal va a ayudarlo. Zero dándose cuenta que para que X tenga alguna chance de salir victorioso, debe anular la Ride Armor. Cuando Vile se distrae para amenazar a X con hacerle daño a Zero si no sigue sus órdenes, es cuando Zero se libera de la cápsula y se aferra a la espalda de la Ride Armor, carga al máximo su Z-Buster llegando al punto de sobrecarga, expresándolo como su única posibilidad. La explosión es tan grande que consume a Zero en su totalidad, pero había cumplido su objetivo.
"X, he recibido mucho daño...mi sistema de auto-reparación no puede manejarlo...mi poder se desvanece rápidamente...Tú poder es más grande de lo que pensé. Tú tal vez puedas destruir a Sigma." ―Zero
Ya han pasado varios años y las Guerras Maverick están por terminar de entre las tantas batallas entre X y Zero contra los ejércitos de Sigma un nuevo compañero se une a ellos Axl .
La seguridad humana se ha perdido, por lo que se ha implementado el proyecto del elevador orbital, el propósito de este es crear una torre gigante con el que los humanos podrán tomar naves que los llevaran a la nueva colonia lunar.
Al final X , Zero y Axl confrontan a Sigma (en un estado incompleto pero funcional) el cual afirma que la razón por la que los nuevos réploids tienen su aspecto es porque pretende invadir la tierra junto con sus "niños", Sigma es derrotado y los Hunters consiguen rescatar a Lumine. Pero Lumine revela ser el autor de su secuestro , Sigma solo era un títere pues la meta de Lumine era ganarse su confianza para obtener su ADN e instalarselo a los Reploids de nueva generación
Lumine invita a X a gobernar la tierra junto con el, pues afirma que solo un Reploid tan sabio como el (recordando que X es el primer Reploid del mundo) para gobernar la tierra, un mundo utópico donde al ser los únicos líderes no habría mas conflictos; y aunque X se ve tentado por la oferta, gracias a Axl se rehusa, finalmente Lumine emergerá con la forma de un Ángel para terminar con ellos.
Cuando Lumine es derrotado, un tentáculo sale de su torso y golpea a Axl (de forma similar a como fue golpeado Zero por Sigma), Zero corta su tentáculo y X con un rayo mega-cargado lo extermina por completo.
Con el fin de Sigma y Lumine la paz en la tierra llegaría nuevamente, mientras en el ascensor orbital Zero se acerca a X quien en sus brazos sostenía a Axl inconsciente para decirle sus últimas palabras antes de llegar a su base de operaciones
"Incluso si los Reploids estamos destinados a unirse a la basura cuando la evolución llegue, todavía tenemos que luchar, no solo contra los Mavericks si no también contra nuestro destino"
Guerras Cyber-Elf En algún periodo de la saga Megaman X, Zero al darse cuenta de que el era el portador del virus Sigma (Virus Maverick), donó su cuerpo al gobierno para investigaciones para la erradicación del virus. Su cuerpo estubó en animación suspendía, y su memoria fue extraída y puesta en un cuerpo de reemplazo. El gobierno puso un grupo de científicos de entre los cuales destacan un/una ancestro de Ciel y el mismo Dr.Weil, crearon al primer Cyber-elf ,la Mother Elf , la cual consiguió la herradicacion del virus Sigma.
Tras este periodo de paz nacieron nuevas clases de elfos, volviéndose tan comúnes como los reploids. Weil, quien enloquecio con la idea de poder al descubrir el potencial de control que la Mother Elf podia lograr sobre los Reploids, corrompe a la misma y la transforma en la Dark Elf y crea unos clones inperfeccionados directamente de ella conocidos como los Baby-elves, corrompiendo a un alto número de reploids; durante la confusión, Weil roba el cuerpo de Zero y con el empieza a construir al "Reploide definitivo" que lo bautizo como "Omega".
En respuesta a las guerras elficas y la creación de Omega, X y el pariente de Ciel logran fabricar una copia exacta del cuerpo de Zero, cargandole su "alma" (memoria). Zero con su nuevo cuerpo y X logran recuperar a la Madre elfo del laboratorio del Doctor Weil.
En los meses Finales de la Guerra,X,Empiza La Batalla Final contra Omega,La batalla prosigue,y X,Dispara una rafaga de plasma ,contra Omega,y al mismo tiempo Declara "¡Yo solo Deseo un Mundo donde todos Puedan cooperar!",Dejando unAgujero,donde se muestra Su "Verdadero Rostro",Tras eso,Zero aparece en el campo de Batalla,Y Le explica a Omega,Que el porfin entendio cual es su Proposito y deja en claro que no permitira que usen "Su Poder" para Matar Inocentes,con La Frase: "Mi poder no es para la destruccion, es para proteger con un amigo las cosas en la que creemos" El poder de Omega era tan grande que solo logran derrotarlo con el Final Strike (ataque combinado de X y Zero)
Weil es arrestado y sometido a la pena mas grande por todas la muertes que causo, su cuerpo fue transformado en un cyborg con una capasidad de regeneración sorprendente negandole la capasidad de morir y exiliado junto con Omega en una nave espacial que orbita alrdededor de la tierra. Con el peligro de que algun rastro del virus siguiera escondido en la memoria de Zero , Zero es nuevamante puesto en animacion suspendida permanentemente.
X al darse cuenta de las consecuencias que produjo la guerra, decide crear a los 4 generales con su ADN para restaurar el medio ambiente de la Tierra. Mientras tanto descide crear una utopia donde humanos y reploides puedan estar en paz. X completa la creación de los 4 generales y Neo Arcadia ; durante este tiempo X se dedicó a la administración de la ciudad mientras que los generales se dedicaron a cumplir labores asignadas por el concilio de los 8 juesez: Harpuia supervisa la creacion de bio-esferas para recrear vida vegetal orgánica, Leviathan supervisa la purificación del agua para los humanos, Fefnir se encarga de recostrir las ciudades destruidas durante la guerras elficas, y Phantos es asignado como guarda espaldas de X.
Cuando Dark Elf reaparecio, bajo el temor que que pudiese corromper mas reploids como la otra vez, X usa su cuerpo como enbase y sella a la Mother Elf en su cuerpo. Manteniendo esto como un alto secreto, ni siquiera los 4 generales son informados del hecho; exepto los familiares de Ciel quienes desarrollan un dispositivo que prevenia cualquier posible escape de la Mother Elf y consiguen rescatar la memoria de X convirtiendolo en un Cyber Elf.
Mientras tanto Ciel fabricó un cuerpo de reemplazo para hacerse pasar por X , Copy X, el nuevo lider de Neo Arcadia no consigue mantener el orden como su predecesor y toma medidas extremas sin la aprovación del concilio, los 4 generales retoman sus puestos y Neo Arcadia se transforma en una potencia militar crimilanizando a todos los reploids ajenos a Neo Arcadia e incluso ejerciendo juicios injustos contra los mismos residentes le da ciudad
Tras esto, Ciel con un grupo de Reploids criminalizados injustamente escapan de Neo Arcadia y forman el grupo de la Resistencia, defendiendo a los demas Reploids inoscentes. Bajo la leyenda de un misterioso y legendario Reploid rojo, Ciel investiga lo que podria ser la última esperanza de los Repliods.
